Como diputada nacional realizó investigaciones, muchas de las cuales terminaron en denuncias en la justicia. Por ejemplo, "La Punta del Iceberg" I y II, sobre las vinculaciones entre el veto a la ley de protección de glaciares, los intereses mineros y la ejecución del emprendimiento de Pascua–Lama entre Argentina y Chile. Fue el origen de la Ley de Glaciares vetada por el Ejecutivo Nacional.
También trabajó sobre los bonos de la ANSeS, que terminó en denuncias penales contra Amado Boudou.
A fines de 2007 fue elegida diputada nacional (periodo 2007-2011) por la Ciudad Autónoma de Buenos Aires del Partido Coalición Cívica –ARI.
Durante su gestión se destacaron sus proyectos de ley de protección ambiental, y de defensa de los jubilados y pensionados.
La mala noticia
La agrupación MR-2012 conducida por Héctor Flores, y que representa en territorio bonaerense a Elisa Carrió, decidió no presentarse en las PASO, y prometió trabajar por una nueva propuesta política provincial.
Tras un plenario realizado en la Cooperativa La Juanita, en La Matanza, la agrupación MR-2012, que encabeza “Toty” Flores renunció a la contienda electoral en al marco de las elecciones Primarias, Abiertas, Simultaneas y Obligatorias (PASO), dado que participar sería convalidar maniobras reñidas con la ética, la moral y la honestidad ejecutadas por adversarios indignos del voto popular.
En su comunicado se afirmó:
“Hemos realizado todos los esfuerzos posibles para que la alternativa carriotista en la Provincia de Buenos Aires estuviera representada y disponible para aquellos bonaerenses que quieren un cambio cultural que eleve las condiciones de vida de todos. La vieja política, manejada por burócratas, cerró todos los caminos a nuestro espacio esperanzador y renovador de la política y sus prácticas, proscribiendo a una corriente de opinión que expresa la postura ética de Carrió. Sin embargo, somos la resistencia y nos caracterizamos por nuestra firmeza a la hora de defender el proyecto de país que queremos, basado en la decencia, la integración social y la dignidad de nuestro pueblo. Construir la herramienta que posibilite canalizar este proyecto será uno de nuestro principales objetivos de aquí en adelante”.
No convalidaremos a Alfonsín y a Stolbizer y sus socios de la Coalición Cívica-ARI bonaerense en el hecho inmoral de coartar el derecho del electorado a elegir a los candidatos que consideran que representen sus intereses”.