Investigadores del Hospital Ricardo Gutiérrez de lograron secuenciar el genoma del Sars-Cov-2 de 26 pacientes infectados de coronavirus.
Se trata de un importante avance que permitirá conocer los linajes de este virus que circulan en la Argentina, también mejorar las metodologías de diagnóstico y colaborar en el estudio global de este virus.
El trabajo estuvo liderado por Mariana Viegas, investigadora del Conicet. Analizaron genomas virales de pacientes con historia de viaje (casos importados), virus provenientes de pacientes que tuvieron contacto directo con casos importados, y virus procedentes de pacientes que no tuvieron contacto confirmado con casos importados (circulación autóctona).
Viegas coordina el "Consorcio interinstitucional para la Secuenciación del genoma y estudios genómicos de SARS-CoV-2” que creó el Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación. El objetivo final es ordenar 800 genomas locales. Los genomas analizados pertenecen al menos a cuatro linajes genéticos (B1, B1.1, B1.3 y B1.5) ya detectados en el resto del mundo.
Dentro de los linajes observados se diferencian secuencias asociadas a otros países como era esperar, mientras que algunas presentan ciertos cambios que podrían potencialmente estar relacionados con circulación local.
Los científicos ahora estudian las relaciones evolutivas entre las secuencias de Argentina, su diversidad y distribución geográfica y temporal dentro del país que, en mayor número, daría correlación entre cambios genéticos y el desarrollo de grados más severos de Covid-19.
También ayudaría a conocer clusters virales que ingresaron al país a través de los pacientes con antecedente de viaje a zonas afectadas, identificar potenciales núcleos virales de circulación autóctona y analizar si los grupos de virus que circulan por las provincias están relacionados
Con sus investigaciones, el equipo argentino, suma información a la base de datos genómicos globales de circulación viral Gisaid (Global Initiative on Sharing All Influenza Data, por sus siglas en inglés).
Del consorcio participan grupos de investigación del Conicet, del Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (Inta) y de universidades nacionales de diferentes puntos del país, especializados en secuenciación, evolución viral y bioinformática. Los tres primeros análisis genómicos locales fueron realizados por el Instituto Malbrán.