Haney describió también la intensa amistad que el actor mantenía con David Miscavige, el líder de la controversial iglesia. "Tom Cruise adora a David Miscavige como a un dios", dijo. "Se adoraban mutuamente."
Haney relató su "escape" de la iglesia en el programa de Leah Remini, "Scientology and the Aftermath" (La cientología y sus secuelas). Remini es una actriz que formó parte de la Iglesia de la Cientología y, tras su salida, se volvió una activista en contra de la Cientología.
En el programa, Haney cuenta que solía trabajar atendiendo a David Miscavige y su esposa, Shelly, quien no ha sido vista públicamente desde 2006. (En 2013, Remini presentó un informe a la policía por la desaparición de Shelly).
Según Haney, Shelly estaba enojada por la estrecha amistad entre Cruise y Miscavige, y repudiaba el trato que recibía por parte del líder de la Cientología (su marido). "Shelly estaba enojada todo el tiempo", dijo Haney. "Dave estaba furioso con todos, día tras día...y no tenía nada para Shelly. Así que ella lloraba todas las noches."
La iglesia negó las acusaciones de Haney. "La Iglesia de la Cientología declaró que Valerie Haney está mintiendo e inventando historias, como parte de su empleo para Leah Remini", dijo un representante de la organización a Fox News, en un comunicado. La iglesia también publicó un video titulado “Valerie Haney: Leah Remini’s Paid Liar" (La mentirosa pagada por Leah Remini).
Remini también ha acusado a Cruise de formar parte de los presuntos abusos a fieles que habrían tenido lugar en la organización, según denuncias recientes de varios exmiembros en el documental 'Going Clear: Scientology and the Prison of Belief' (Queda claro: La cienciología y la prisión de las creencias), de Marty Rathbum, un exmiembro de alto rango del grupo religioso.
"Él es muy consciente de los abusos que ocurren en Cienciología. Él ha sido parte de ellos", dijo Remini. "La gente piensa que Tom es una víctima inocente en todo esto. La mayor parte de los cienciólogos lo son, pero él no está en la misma categoría", afirmó.
Remini agregó también que "a los cienciólogos se les dice que Tom Cruise está salvando el mundo, por lo que es considerado una deidad dentro de la Cienciología."
Rathbun cuenta en el documetnal que la iglesia tomó una serie de medidas para convencer al actor de alejarse de su primera esposa, Nicole Kidman, ya que ella no era creyente.