Los fundadores de Radio Colonia –hoy fallecidos– fueron Ricardo Bernotti y Raúl Montellano. Ambos eran nacidos en la Argentina pero de familia uruguaya, por lo que habían obtenido la doble nacionalidad. El padre de Bemotti había tenido una emisora en la localidad bonaerense de Quilmes, Radio Bernotti, y más tarde fue dueño de Radio del Pueblo. Cuando en 1933 fundó la emisora uruguaya, junto a Montellano, la llaman 'Radio Popular de Colonia'. En aquellos primeros tiempos, la radio tuvo un perfil sensacionalista.
La popularidad de Radio Colonia en la Argentina nació en la década del cuarenta, luego del golpe militar del general Pedro Ramírez. El nuevo gobierno nombró como ministro de Educación a Martínez Zuviría, a quien se le ocurrió “castellanizar” los tangos, ya que consideraba que el lunfardo era impropio y vulgar. Radio Colonia, por ser extranjera, continuó emitiendo las letras originales, por lo que sobre todo los porteños comenzaron a acostumbrarse a sintonizarla.
En 1955 la Radio adoptó una línea noticiosa que fue calificada como “gorila” o adicta al régimen que derrocó al gobierno peronista. Cabe recordar que durante la 1era. presidencia de Juan Domingo Perón la mayoría de los medios de comunicación estaba o bien en manos del Estado, o bien en manos de "amigos", y en el país sólo se conocía la versión oficial de los hechos. En ese momento, también muchos argentinos se enteraban de las reales noticias del país a través de Radio Colonia.
Además de fútbol, música e informativos, también se emitían algunas audiciones como las de Niní Marshall con su personaje Catita, cuyas grabaciones habían sido compradas a la misma actriz.
A mediados de los años sesenta, Héctor Ricardo García – propietario del matutino Crónica – adquirió Radio Colonia y le confió su dirección al periodista Ariel Delgado, quien había ingresado en la emisora unos años antes, al frente del noticiario de las 13 horas. Por aquellos años, el informativo incorporó noticias políticas del Río de la Plata.
La audiencia de Radio Colonia en la Argentina alcanzó records históricos cuando otras fuerzas militares derrocaron a los presidentes civiles Arturo Frondizi y Arturo Illia.
Con el paso de los años Radio Colonia se transformó en el único canal de información que tuvo la Argentina en los años duros de la dictadura, cuando la guerra de Malvinas y en cuanta oportunidad de inquietud o rumores alarmistas corrían en Buenos Aires, porque sabían que sólo desde Colonia se les diría la verdad.
La importancia de Radio Colonia radica en que quebró la aparentemente infranqueable censura ejercida por los diversos regímenes autoritarios de la Argentina.
"La radio se defendió siempre gracias a la torpeza de los gobiernos argentinos. Antes de que yo llegara, a un gobierno se le había ocurrido castellanizar los tangos y en lugar de 'Percanta que me amuraste' había que decir 'Señorita que me abandonaste'... La radio, lo único que hacía era pasar los viejos tangos de Gardel y con eso lograba la mayor audiencia", contó Delgado en una entrevista con Fabián Magnotta.
"Años después, la radio lograba escapar a la censura de sus colegas argentinas. Por Colonia, los argentinos se enteraban qué estaba haciendo Perón en el exilio o que habían asesinado al periodista Rodolfo Walsh. Por supuesto, recibíamos presiones y hasta éramos interferidos, pero con esas cosas mayor fuerza lográbamos", continuó.
Como anécdota, recordó que a fines de la década del '50 los informativos debían escribirse y enviarse a seis organismos diferentes para su aprobación. No olvida tampoco la suspensión de la que fue objeto por nombrar al entonces depuesto Gral. Juan Perón. "Resulta que el Presidente Aramburu habló en un discurso sobre el prófugo Perón. Yo, al hacer el resumen del mensaje presidencial, mencionó eso y fui suspendido por nombrar a Perón. El Presidente lo puede nombrar, pero usted no, me explicaron...".
Cuando en 1973 se instaló la dictadura en Uruguay, comenzaron los problemas. A partir de 1976, los gobiernos militares uruguayo y argentino se unieron en el hostigamiento.
En 1979 García vendió la radio a Mario Kaminsky, su actual propietario, dueño también de la empresa discográfica Microfón. A comienzos de 1990, parte de las acciones de Radio Colonia fueron adquiridas por Casa Tía – cuya filial uruguaya se llama Casa Tata – y la empresa de aeronavegación Líneas Aéreas Privadas Argentinas (Lapa).